Cesty patria k prvkom, ktoré na tvár a funkčnosť krajiny vplývajú v najväčšej miere. Okrem života ľudí vplývajú aj na život zvierat a rastlín. R1 PR1BINA nezasahuje do chránených oblastí a neprechádza ani lokalitami Natura 2000 (sústava chránených území európskeho významu).
Najbližšie k trase sa nachádza chránené vtáčie územie Tríbeč, územie európskeho významu Dvorčiansky les a Zoborské vrchy.
Okolie cesty sa vyznačuje veľkou druhovou pestrosťou. Žije tu približne 6 000 druhov živočíchov a 1200 druhov cievnatých rastlín. Okolie cesty budú čoskoro lemovať desiatky tisíc novovysadených kríkov a tisícky stromov, ktoré budú tvoriť zelenú prírodnú bariéru.
